在《医部全录》里面有许多祝由术的符咒，不明白的人就觉得是迷信
一、关于祝：祝含告的意思，但这与我们寻常所说的告诉，通告又有不同，他包括了祈福和祝愿的心理成分。当初商王成汤体察民情，一天，来到一地，看见猎人成群的布置陷阱和罗网，布网的人喜气洋洋，高声祝道：“从天来者，从地来者，从四方来者，都进到我的罗网中，无一漏网。”商王于心不忍，便向前将网解除三面，只留一面，并改祝道：“想到左边，便到左边；想到右边，便到右边；想向上去，便向上去；想往下来，便往下来，不要活命的，便进入我的网中。”猎人听后，大为感动。这就是在历史上流传的网开三面的故事。这里面有两次用了祝，这里的祝不是简单的说和命令，可见它包含了思想愿望和行动的一体，告诉却可以是心不由衷的泛泛之谈，而祝同注，在祝的活动中，始终要用精神关注你的言行，就整体而言愿望多一点，对患者要倾注你的全部心血，不能言行不一，这同时是古人的道德风范。在后期的演化过程中，符也成为了祝的表现形式，要求你的言行要相符，对于治疗疾病尤为如此！你治疗超出了怯病的主愿，含有一丝惰性，含有一丝利欲之心，都直接影响治疗效果，都不是祝。
医生与患者亲同一体，号脉时要高度关注脉的状态，治疗要直达病所，才可以改变病患状态，单纯靠化验，不关注患者病情，虽科学但治疗效果必差！
祝过去作为中医的主体，是与当时的社会环境有关，过去的医疗体制是“乡约祝医”的状况，中医作为个体存在，是点的重视，所以他可以对重点病例做细致的研究，现在是医院治疗，是点的集合，对患者进行分类治疗，找出相同症状，统一治疗，他的关注程度就差多了，我们总对学生们讲，同一个疾病症状在不同年龄，不同性别，不同的阶段，你要看到不同，拿出不同的治疗方案，虽用药相同，要体会治疗手段的不同！否则你就是工不是医。
二、关于由
从字意上来讲，由就是由来，中医祝由科研究的就是疾病的由来，也就是人从那里来的问题，病从那里来的问题，人正常的生长，叫无疾，非正常发展叫得病，得病后要考虑致病原因，祛除致病原因后靠正常生长，病自然就好，不去致病原因，吃多少药，也只是缓解延长疾病状态和减轻疼痛作用。就治疗方式和设备，以及先进的现代化技术，中医西医可以互通，但从病由的认识有根本的区别
就病或生命本源来说，中国文化决定认识是运动产生的；而西方受西教影响，认为是上帝造的，所以对物质本原的发生，论述甚少，是从有物质开始研究的。而研究物质发生的本原对事物的存在与发展，有决定的意义！而疾病的发生，就是治疗疾病的根本所在。所以古代先贤都把他作为修身立命的根本。
佛祖悉达多开始向圣者卡拉玛学习呼吸和四禅八定的学问，又从隐士拉马普特拉学习苦修，但都没能找到消除痛苦的原因和祛除痛苦的方法，最后重新调整思维方式，终于彻底觉悟，立地成佛。道家认为世界的开始由道开始，世界处于混沌状态（也就是祝由的状态），在运动中逐渐有了边界（相当于现代星云），就是太极，逐渐有了凝聚作用（祝，就是神的作用），出现了两仪（阴阳），在阴阳的演化过程中，由于阴阳的极化作用，产生出不同于阴阳的第三类中性物质，就是三才，他具有超强的凝聚力（相当于现代空洞），这个凝聚又重新产生新阴阳；也就逐渐产生世界万物。（见云芨七签）
就人体而言：父精母血，在交合的一刹那，还没有形成受精卵的时候，他既不体现父体特性，也不体现母体特性，也就是混沌状态（叫祝由状态），向正方向发展就形成了人，向反方向发展就形不成个体，所谓“顺之成人，逆之成仙”化了，逐渐形成阴阳（相当于细胞分裂的二分体），在进一步向四分体的转化分裂过程中，必然存在这一刹那是三才，存在两个极化细胞和一片混化物质，这一片混化物质，在神的支配正常发育，形成两个新细胞变成四分体，不受神的支配，只是简单复制就是变成葡萄胎，形成不了人！逐渐发育就逐渐成人，不定序发育就成了“癌”。
在形成人以后，发育长大祝由状态随时出现，决定了你的细胞发生和发展，并随神的存在形成不同的器官组织，并参与运动，神没有了，人死了，只留肉体，是臭皮囊！神出了问题，细胞就向错误方向发展，就是病，你给他一个新细胞（如非常准确的药物），先不论“猪肉贴不到羊身上的问题”由于他们起自不同的祝由状态，来自不同的母体，不是一个爹妈生的，相互不兼容，只能会相互对抗，处于相互斗争状态，表现稳定的体征状态，只有重新建立神的状态，由祝由状态做载体，病才能痊愈，身体做正常的生化。
根本治疗疾病从祝由状态开始。
三、关于鬼、神
鬼神之事，从古代就有多重解释，所谓“仁者见仁，智者见智”，中医祝由科向来有“驱使鬼神”之说，鬼神之事说不清，直接关系到对祝由科的认识,以及正确掌握祝由科的治疗方法。
《黄帝内经》通篇不言邪祟鬼魅，所以有“黄帝曰：其无遇邪风，又无怵惕之志，卒然而病，其故何也？唯有因鬼神之事乎？岐伯曰：此亦有故邪留而未发也。因而志有所恶，及有所慕，血气内乱，两气相搏，其所从来者微，视之不见，听之不闻，故似鬼神。黄帝曰：其有祝由而已者，其故何也？岐伯曰：先巫者，因知百病之胜，先知百病之所从者，可祝由而已也。”张介宾的解释是“凡百病五行之道，必有所以胜之者；然必先知其病所从生之由，而后以胜法胜之，则可移精变气（邪僻之事，唯此可疗），祛其邪矣。病有药石所不及，非此不可者，惟先巫知之，故可祝而已也。然则先巫用祝之妙，正不在祝，其机在胜之而已。”《解围元薮"卷一"风癞论》：“夫阴阳神煞，不可渎其无而辟慢之，亦不可信其有而谄媚之，皆惑于偏也。且妖邪之祟，若触犯于人，不过一时之间，岂有终身随而为祸之理?亦因人气血不正，受其邪气而病生焉。若调其气血，清其思虑，则神正而复元，使邪气渐消而安矣。故云燮理阴阳以和元气，大道君子也。医家十三科之内亦有祝由一科，以符水咒诀禳辟邪魅妖氛，而归揖正气。”
《圣济总录"卷第四"治法"祝由》：“上古移精变气，祝由而已。盖其俗淳，其性朴，其病微，至诚不二，推病由而祝之，以通神明，故精可移而气可变也。其或舍信悫为疑惑，指祝由为无益之术；而精气不纯，邪毒深蓄，虽有祝由，不能已者，非古今异术，人心异也。善医者察病浅深，虽不概以此治。至于病有鬼神之注忤。虫兽之螫毒，必归于祝由。是以，周官疡医，掌众疡祝药劀杀之齐，必先之以祝，盖医之用祝尚矣，疡尤宜焉，大抵意使神受，以正驱邪，则一也。”
四、祝由中的鬼化符
在《医部全录》里面有许多符咒，不明白的人就觉得是迷信，其实不然，同是清代，一部介绍宗教的书《万法归宗》中就有记载批驳说：“一点灵光即是符，人间错会墨与朱，古仙不肯分别说，迷却蹉跎大丈夫”。符咒，并不仅仅是朱墨写的字，而是通过患者与医生产生心理共鸣，利用神秘感以达到更好的效果；比如，以前治疗拉稀腹泻时，写一个符，即“雨”字头，左边“食”字边，右边一个“鬼”，就是喝脏水后得的病，然后念咒：“天上水，地下水，龙王嘴里也是水，手里是神水，口里是法水，一喷天，二喷地，喷尽天下疟疾鬼，太上老君急急如律令” 给病人喝一碗黄连水，然后就好了。其实实质是，病人以为雷把鬼吃了，精神放松，心情好了，有利于小肠大肠的功能发挥。祝由科医生心病与身病同时治疗，提倡疾病的整体治疗，要比现在分科单一症状治疗好的多。
许多符中的画法中揭示了人体正常的生命活动，如：头上的党字头，三点说的是“天门常开，地户常闭”；口指的是脑内宫识；“飠”指的是胃肠中的肺气调摄和气的状态，等等，这在后面还有详细介绍。
这里有一个坚持科学的世界观来分析符咒的问题，在网上浏览“祝由”我们不难发现，绝大部分认为祝由科是经过气功锻炼后，应用符咒对患者治疗，其实这很狭隘和片面，是受了道家符咒的影响，与中医祝由科关系不大，试想一下，再高明的气功师，是人不是神仙，单凭画符、念咒，也不可能对疾病起决定作用 。
其实现在已经把符咒偏执化了，形象化了，单指写在纸上表达一定意义的看不懂的文字和念叨谁也听不明白的话；符的正确的讲法应该是：要人们符合外界的客观规律，按照客观规律办事，也就是法；咒指的是：改造自然的本领和具体办法，就是治疗技术。
现在人们通常把神棍用来骗人谋取利益的把戏叫法术。正确的解释应该是：利用客观规律，选择适当的方法，改变客观物质世界，与现在所说有本质的区别，“法术者，人主之所执，为治之枢。术藏于内，随务应变；法设于外，适时御人”《刘子集注》，法术早在汉代就有论述：法术的运用是由人来执掌，是办事的枢纽，处理事物的方法，随外界事物的变化而变化，处理事物的理论，用来告诉别人。用在现在就是应当告诉治疗疾病的道理，而不必连篇累牍告诉具体的治疗和用药方法，避免读者重术而轻理,造成偏颇，食用龙胆泻肝丸造成肾衰竭，食用四环素造成四环素牙，小孩长时间食用高钙食品造成内分泌失调等，都是在经济利益的驱使下的后果。
符咒的含义和道德的含义是相一致的，道（符）为体，德（咒）为用，道是事物的固有性质和规律，德是顺应道的应用 ，这与现代对道德的解释有本质的不同；只是在不同的领域理解和应用不同，有的人为了树立自我，丑化宗教，把极少部分画符、念咒的迷信成分给强化了，特别是不了解祝由科的全部实质，不了解祝由科产生神奇功效的原因和历史，便笼统地用现代人的观点去解释古人，就逐渐把他的本质淡化了。容易把它同鬼神等迷信活动联系起来，特别是媒体的不正当渲染，使其更加神秘化了，一些人只能依靠宗教中道家符录派的记载，了解只言片语，妄加猜测，以致以讹传讹，与人口舌。
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